Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms