Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a1P19437 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms