Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc1P18828 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms