Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms