Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApcsP12246 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApcsP12246 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApcsP12246 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms