Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nid1P10493 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms