Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06335 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06335 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06335 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06335 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06335 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06335 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P06335 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06335 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06335 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms