Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtnd1P03888 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtnd1P03888 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms