Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01667 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01667 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01667 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01667 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01667 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01667 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01667 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01667 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01667 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01667 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01667 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms