Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec11aO88200 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms