Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlkO54988 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SlkO54988 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SlkO54988 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SlkO54988 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SlkO54988 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SlkO54988 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SlkO54988 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SlkO54988 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SlkO54988 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlkO54988 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlkO54988 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SlkO54988 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SlkO54988 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SlkO54988 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SlkO54988 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SlkO54988 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SlkO54988 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SlkO54988 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SlkO54988 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SlkO54988 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SlkO54988 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SlkO54988 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SlkO54988 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SlkO54988 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms