Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TsksO54887 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TsksO54887 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TsksO54887 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TsksO54887 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TsksO54887 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TsksO54887 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TsksO54887 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TsksO54887 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TsksO54887 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TsksO54887 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TsksO54887 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TsksO54887 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TsksO54887 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TsksO54887 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TsksO54887 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TsksO54887 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TsksO54887 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TsksO54887 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TsksO54887 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TsksO54887 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TsksO54887 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TsksO54887 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TsksO54887 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TsksO54887 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TsksO54887 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TsksO54887 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TsksO54887 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TsksO54887 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TsksO54887 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TsksO54887 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TsksO54887 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TsksO54887 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TsksO54887 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TsksO54887 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TsksO54887 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TsksO54887 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TsksO54887 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TsksO54887 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TsksO54887 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TsksO54887 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms