Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab33bO35963 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms