Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf12O35738 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf12O35738 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf12O35738 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klf12O35738 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf12O35738 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf12O35738 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf12O35738 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf12O35738 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf12O35738 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf12O35738 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf12O35738 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf12O35738 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf12O35738 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf12O35738 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf12O35738 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf12O35738 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf12O35738 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf12O35738 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms