Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcshO08795 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms