Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm19965J3QNY8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm19965J3QNY8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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