Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20918J3QN17 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms