Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r58G3X9U3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms