Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zkscan2G3X952 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms