Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NpcdF8VQB8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NpcdF8VQB8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms