Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms