Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss56F2YMG0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss56F2YMG0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms