Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms