Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L8

Zfp493, Zinc finger protein 493, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp493E9Q1L8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Zfp493E9Q1L8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp493E9Q1L8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zfp493E9Q1L8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zfp493E9Q1L8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zfp493E9Q1L8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp493E9Q1L8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Zfp493E9Q1L8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms