Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms