Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap70D3YVL2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap70D3YVL2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap70D3YVL2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap70D3YVL2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap70D3YVL2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap70D3YVL2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap70D3YVL2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap70D3YVL2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap70D3YVL2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms