Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mterf1bB9EJ57 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms