Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap58B2RW38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms