Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmem238A9JSM3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms