Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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