Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms