Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms