Protein–RNA interactions for Protein: A0A589

TCRBV7S2A1N4T, V_segment translation product (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms