Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms