Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms