Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uso1Q9Z1Z0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms