Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W8

Atp12a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp12aQ9Z1W8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp12aQ9Z1W8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp12aQ9Z1W8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp12aQ9Z1W8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms