Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx1Q9WV80 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms