Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJB4Q9UDY4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms