Protein–RNA interactions for Protein: Q9R216

Fzd9, Frizzled-9, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd9Q9R216 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fzd9Q9R216 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fzd9Q9R216 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fzd9Q9R216 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fzd9Q9R216 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fzd9Q9R216 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fzd9Q9R216 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fzd9Q9R216 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fzd9Q9R216 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fzd9Q9R216 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fzd9Q9R216 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms