Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma4Q9R1P0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms