Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid2Q9QUS6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms