Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkl2Q9QUK0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl2Q9QUK0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms