Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms