Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arl6ip1Q9JKW0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms