Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms