Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn10Q9ESK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn10Q9ESK3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms