Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms