Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp27a1Q9DBG1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms