Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pop5Q9DB28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pop5Q9DB28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms